打微孔的方法有很多种，冲压、钻头钻孔、激光打孔等，要论哪种打孔方法专业，其实要看打孔的具体材料。
冲压打孔主要针对较薄的板材，通过模型冲压使得板材被压切掉一部分，形成一个空洞，这种方式打的孔洞的切面会偏向板材的一面，从正面看很平滑美观，从背面看则会有切面突出于板材平面的问题，所以比较适合于对加工面的一面有要求的打孔，而且孔洞的形状可以随模型的改变而改变，可以打出不同形状的孔。
钻头钻孔是使用钻头在机床上对板材进行旋转钻孔，这种方式只适合打圆形孔，对于异形孔的加工能力很低，但是可以对较厚的板材进行钻孔，可以打不对穿的孔，钻孔效果好，速度和深度比较容易控制，孔型圆滑。不过这种钻孔比较依赖钻头的质量，对板材的材料性质也有要求。
而激光打孔激光打孔技术具有精度高、通用性强、效率高、成本低和综合技术经济效益显著等优点，已成为现代制造领域的关键技术之一。可在硬、脆、软等各类材料上打孔，速度快、效率高、经济效益好；适用于数量多、高密度的群孔加工。
对于玻璃小瓶打微孔加工，冲压，钻头钻孔，激光打孔，最合适的是激光打孔。玻璃属于易碎品，玻璃小瓶子的瓶身较薄，而激光打孔是属于无接触加工方式，是利用高功率密度激光束照射被加工材料，玻璃打孔机光束质量好，聚焦光斑更小，使材料很快被加热至汽化温度，蒸发形成孔洞，具有高效率、安全、稳定、操作简便等特点。可打孔范围：小孔:1.00～3.00(mm);次小孔:0.40～1.00(mm);超小孔:0.1～0.40(mm);微孔:0.01～0.10(mm);次微孔:0.001～0.01(mm);超微孔:<0.001(mm)，对玻璃小瓶打微孔可以轻松解决。
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